PDA

Просмотр полной версии : Немного о генетике наших порхатых "друзей"



Waffen_SS
25.05.2013, 10:06
Реконструкция элементов ДНК-генетики евреев
А.М. Тюрин Аннотация
Рассмотрены фактические ДНК-генетические данные, характеризующие евреев (Клёсов, 2007) по отцовской линии. Сделаны следующие выводы и заключение.
Методический вывод: имеющиеся фактические данные, характеризующие евреев, позволяют выполнять общие и частные ДНК-генетические реконструкции, причем, это можно делать без опоры на известные версии их истории.
Генохронологический вывод: евреи, как социальная общность, обособились в 17 веке н.э..
Геногенеалогический вывод: ближайшими родственниками евреев с гаплотипом Коэна являются турки, армяне, курды (возможно греки), прямые их генетические родственники составляют в Турции 1,5% мужского населения.
Геногеографическое заключение: социальные группы евреев сформировались, в основном, в тех регионах, в которых они проживали в начале (условно) 19 века.
Ключевые слова: ДНК-генетика, генохронологическое датирование, геногенеалогия, евреи.
Оглавление
1. Постановка задачи (http://new.chronologia.org/volume8/turin_dnk.php#01)
2. Основы ДНК-генетики (http://new.chronologia.org/volume8/turin_dnk.php#02)
3. Генохронологическая модель евреев (http://new.chronologia.org/volume8/turin_dnk.php#03)
4. Анализ структуры выборки и датирование групп евреев (http://new.chronologia.org/volume8/turin_dnk.php#04)
4.1. Принципы анализа структуры выборки
4.2. Вся выборка
4.3. Ашкенази-коэны (http://new.chronologia.org/volume8/turin_dnk.php#43)
4.4. Ашкенази-левиты (http://new.chronologia.org/volume8/turin_dnk.php#44)
4.5. Ашкенази-израэлиты
4.6. Сефарды-коэны (http://new.chronologia.org/volume8/turin_dnk.php#45)
4.7. Сефарды-левиты (http://new.chronologia.org/volume8/47)
4.8. Сефарды-израэлиты
4.9. Курдские евреи
5. Элементы ДНК-генетики евреев (http://new.chronologia.org/volume8/turin_dnk.php#05)
5.1. Элементы генохронологии евреев
5.2. Элементы геногенеалогии евреев
5.3. Элементы геногеографии евреев (http://new.chronologia.org/volume8/53)
6. Обсуждение результатов формального датирования (http://new.chronologia.org/volume8/turin_dnk.php#06)
7. К вопросу о калибровке скорости мутаций (http://new.chronologia.org/volume8/turin_dnk.php#07)
8. Общие выводы (http://new.chronologia.org/volume8/turin_dnk.php#08)
9. Вместо заключения (http://new.chronologia.org/volume8/turin_dnk.php#09)
Источники информации (http://new.chronologia.org/volume8/turin_dnk.php#lit)
1. Постановка задачи
В публикации [Клёсов, 2007] приведены фактические ДНК-генетические данные, характеризующие евреев, и выполнен их анализ. По его результатам можно сделать однозначный вывод: общий прародитель евреев жил примерно 3600 лет назад. Не имеется никаких противопоказаний, против его идентификации с библейским Авраам. Представлялось целесообразным выполнить анализ «тонкой» структуры выборки с целью оценки степени достоверности вывода о существовании 3600 лет назад единого прародителя евреев. Это задача минимум. Задача максимум – реконструкция элементов ДНК-генетики евреев. Причем, поставлено жесткое ограничение - последняя задача должна быть решена без опоры на какие-либо представления об истории евреев.
2. Основы ДНК-генетики
В последнее время форсированными темпами развиваются генетические исследования Человека. Применительно к изучению его прошлого обособились три дисциплины: геногенеалогия, геногеография и генохронология, которые являются составными частями ДНК-генетики. Они базируются на одном и том же массиве данных – генетических маркерах человека. Наиболее полно основы ДНК-генетики изложены в публикации [Клёсов, 2007].
Различают две группы генетических маркеров человека. Генетические маркеры (гены), которые:
- не влияют на биологические особенности людей, то есть, не определяют их «конкурентоспособность» в выживании в определенных природных и социальных условиях;
- определяют биологические особенности людей и являются объектом естественного отбора.
Все три дисциплины ДНК-генетики базируются только на первом классе маркеров. Маркеры же второго класса привлекаются, в основном, при интерпретации формальных результатов исследований. Имеются маркеры, не влияющие на биологические особенности людей, которые передаются только от отца к сыну или от матери к дочери. Здесь мы рассмотрим только «мужские» маркеры. Их выделили в Y-хромосоме. В ней имеются участки, состоящие из последовательностей одинаковых нуклеотидов. Конкретные участки как раз и являются маркерами. Генетические исследования выполняются по 6, 12, 17, 25 и 37 маркерам. Применяется стандартная запись генетического портрета конкретного человека (его называют гаплотипом). Например, запись шестимаркерных гаплотипов трех человек выглядит так:
14-16-23-10-11-12
14-16-22-10-11-12
14-16-24-10-13-12
В первом маркере для трех гаплотипов содержится 14 последовательностей нуклеотидов (число последовательностей называется аллелями), во втором – 16. А в третьем маркере число последовательностей у гаплотипов различное. Дело в том, что при передаче гаплотипа от отца к сыну иногда случаются мутации, имеющие строго определенный тип. В копию маркера, которая передается сыну, добавляется или из нее исключается один нуклеотид. Мутации как раз и обеспечивают различия в гаплотипах людей. В нашем примере второй гаплотип отличается от первого на 1 мутацию (третий маркер), а третий – на три мутации (третий и пятый маркеры). Для простоты часто пишут «различаются (отстоят) на «один шаг» или на «три шага».
Здесь приведем только самые общие основы генохронологии, причем сделаем это на примере Острова. Имеется изолированный Остров. На нем мы будем выполнять виртуальные генетические исследования. Поселим на Остров несколько женщин детородного возраста и одного (всего одного!) мужчину (назовем его «Адамом»). Через некоторое время на острове будет проживать популяция с установившимся равновесием мужчины-женщины, причем все мужчины будут потомками Адама. У части мужчин гаплотипы будут полностью соответствовать гаплотипу Адама, у другой части они будут иметь незначительные отличия, обусловленные мутациями. Эти отличия можно оценить по результатам генетических исследований и записать как количество мутаций на 1 человека. Можем ли мы по этим данным вычислить время жизни Адама (время, прошедшее с начала эксперимента)? Нет. Для этого нам необходимо знать еще один параметр – скорость мутаций. Оценить его легко. Нужно в выборке мужчин, для которых мы определили их гаплотипы, выделить пары отец-сын и оценить по ним число мутаций. По этим данным мы получим искомый параметр – скорость мутаций, выражающаяся в ее вероятности при единичном акте передачи генетических маркеров (при одной генерации). Зная общее число мутаций и ее скорость, мы простыми арифметическими действиями вычислим число генераций от Адама до времени проведения генетических исследований. Для того, чтобы пересчитать этот параметр в годы (лет назад), нужно задать длительность одной генерации. При выполнении генетических исследований за ее длительность обычно принимается 30 лет. То есть, мы без труда решили главную задачу генохронологии – оценили время жизни Адама.
А как нам датировать Адама в том случае, если на Острове установился социальный порядок, при котором отцы не знают своих сыновей? Очень просто. Надо оценить скорость мутаций по выборке отец-сын с «Большой земли». Такие исследования генетиками выполнены. По их результатам установлено, что скорость мутаций в каждом маркере различна, но для решения практических задач можно пользоваться ее усредненным значением – 0,002 на маркер на поколение. То есть мутация одного маркера происходит в среднем раз в 500 поколений. Если исследования выполняются, например, на 6 маркерах, то скорость мутаций нужно увеличить соответственно в 6 раз.
В ДНК-генетике имеется и супермаркер. По нему определяется гаплогруппа. «Таких гаплогрупп к настоящему времени выделили восемнадцать, от А до R, плюс полторы сотни подгрупп. Если отвлечься от подгрупп, то основная гаплогруппа, в которую входят евреи - J, а славяне - R. Это буквы выбраны произвольно, и ничего не обозначают кроме принадлежности к одной гаплогруппе. Например, гаплогруппы А и В - африканцы (В - народность пигмеев), С - Австралия и Океания, Сибирь, Япония, североамериканские индейцы. Уже примерно ясно, как появлялись народности, их исторические, генеалогические общности. Гаплогруппа J - ближневосточного происхождения, и охватывает также Турцию, Кавказ (Армению и Грузию), Эфиопию, Сомалию, северную Африку, арабские народы, курдов, балканские народы, Италию, Грецию. Это отражает передвижение народностей, их миграцию. Поскольку в этой широкой гаплогруппе есть свои кластеры, ее подразделяют на подгруппы J1 и J2. То же и в гаплогруппе R: R1 - Европа и Западная Азия, R2 - Индия, центральная Азия, Кавказ. Подгруппа R1a - славяне (особенно R1a1), многие ашкеназы (возможно, потомки хазар или славян), Восточная Европа, центральная Азия, Индия; R1b - Западная Европа, Малая Азия.» [Клёсов, 2007, Часть II].
3. Генохронологическая модель евреев
Ведем понятие «социальная общность». Это группа людей, осознающих свое единство, хотя бы по одному идентификационному признаку. Все люди, входящие в социальную общность «Евреи», осознают свое единство хотя бы по одному признаку – они считают себя евреями. Этого и достаточно. Генохронологическая модель социальной общности «Евреи» приведена в публикации [Клёсов, 2007, Часть II]. Ее основные параметры следующие. В этой общности можно выделить кластер «Еврейский гаплотип», восходящий е единому прародителю – библейскому Аврааму. Время жизни прародителя – 3600 лет назад. В рассмотрение принят шестимаркерный гаплотип. За модальный гаплотип кластера «Еврейский гаплотип» принят модальный гаплотип коэнов: 14-16-23-10-11-12. За 3600 лет сменилось 120 поколений. Длительность поколения составляет 30 лет, а скорость мутации - 0,002 на поколение. Математическая модель мутаций упрощена. Она не учитывает вероятность возвращение мутирующего маркера в исходное состояние в результате повторной мутации. В соответствии с принятой моделью, сегодня 24% евреев, попавших в кластер «Еврейский гаплотип» должны иметь его модальный гаплотип, 34% - гаплотип с одной мутацией, 25% - с двумя, 12% с тремя, 4% с четырьмя, и 1% - с пятью. В пределы гаплотипов, имеющих от 0 до 5 мутаций попадает более 99% кластера. Общее количество мутаций на 1 человека составляет 1,46. В графическом виде распределение количества мутаций показано на рисунке 1. Конечно, на самом деле это распределение должно быть симметричным (показывать отклонение в разные «стороны» от исходного гаплотипа). Но такие тонкости для генохронологии излишни. Исходя из этой модели, в кластер «Еврейский гаплотип» включены все гаплотипы, отличающиеся от гаплотипа Коэна на 1-5 шагов. Сегодня этот кластер является только частью социальной общности «Евреи». Другая ее часть сформирована потомками отцов, в него не входящих. По сути, генохронологическая модель кластера «Еврейский гаплотип» является Островом. Наш Адам - это Авраам. Он появился на Острове 3600 лет назад. Эту модель назовем «Моделью Клёсова».
Модель Клёсова слишком проста. Усложним ее. Допустим, что на Остров попадали и случайные путешественники. Они тоже оставили свое потомство. Можем ли мы в этих условиях датировать Адама? На этот вопрос имеется только «условный» ответ. Если на Остров попадали случайные люди (из разных географических регионов Земли), то мы легко выделим в массиве генетических данных кластер потомков Адама. По нему можно выполнь его датирование. Если же на Остров попадет хотя бы один человек из того племени, в котором родился Адам, то могут возникнуть проблемы. Гаплотипы этих двух мужчин будут близкими (отличающимися на относительно небольшое количество мутаций, например, на 1, 2 или 3). В этом случае в кластер потомков Адама попадут и потомки его соплеменника. Датирование Адама по этому кластеру приведет к систематической ошибке типа «удревнение». То есть, в соответствии с этой моделью датированию Адама должен предшествовать детальный анализ генетической ситуации на Острове.
Все евреи разделены на 6 групп: ашкенази-коэны, ашкенази-левиты, ашкенази-израэлиты, сефарды-коэны, сефарды-левиты и сефарды-израэлиты. Ашкенази – европейские, а сефарды – африканские и азиатские евреи. Коэны и левиты – кланы потомственных священников, израэлиты – все остальные евреи.

далее тут:
http://new.chronologia.org/volume8/turin_dnk.php

Fog
25.05.2013, 14:36
http://new.chronologia.org/ - не советовал бы доверять информации с сайта хроноложников. Это те Фоменко и Носовский, у которых египетские пирамиды построены в 21 веке.

Neovelibor
25.05.2013, 18:08
Кроме того, гаплогруппы сами по себе мало о чём говорят, вспомним пресловутую "R1a-славянскость" таджиков или "западных европейцев по R1b" башкир.

Ленивый Кот
25.05.2013, 18:13
По его результатам можно сделать однозначный вывод: общий прародитель евреев жил примерно 3600 лет назад. Не имеется никаких противопоказаний, против его идентификации с библейским Авраам.

Шедевр лженаучной мысли. Интересно, а семиты-амореи, захватившие Шумер- были КЕМ?! Наверное, а'ийцами... :))

Waffen_SS
08.06.2013, 07:11
Молекулярная генетика евреев
Аннотация: Рассмотрены результаты полногеномного анализа однонуклеотидного полиморфизма 7 еврейских популяций (Atzmon, 2010). Прародина евреев локализована территориями Израиля, Ливана и Сирии. Наиболее близким к их предкам является геном сирийских евреев, друзов, бедуинов и части палестинцев. Близким – турецких и греческих евреев. Достоверно можно утверждать, что в прошлом существовала однонаправленная миграция евреев Турции за ее пределы. Потомки мигрантов стали ашкенази, итальянскими и иракскими евреями. Ашкенази отличаются высокой генетической однородностью, что не соответствует времени появления их предков в Европе – 10 век. Авторы публикации (Atzmon, 2010) несоответствие объяснили на основе такой категории популяционной генетики, как «бутылочное горлышко». Действие этого фактора было в период до 15 века. Вторая версия, объясняющая высокую генетическую однородность ашкенази, может базироваться на Новой Хронологии А.Т. Фоменко и Г.В. Носовского или других гипотезах, альтернативных Традиционной Истории. Ашкенази, как религиозно-социальная общность сформировались в 14-15 веках.

Ключевые слова: евреи, популяционная генетика, полиморфизм, прародина, миграции, хронология.

1. Введение В последние годы форсированными темпами развиваются генетические исследования Человека. Применительно к изучению его прошлого обособились три дисциплины: геногенеалогия, геногеография и генохронология, которые являются составными частями популяционной генетики. Они базируются на одном и том же массиве данных – генетических маркерах человека. Имеются маркеры, не влияющие на биологические особенности людей, которые передаются только от отца к сыну (их выделяют в Y-хромосоме) или от матери к дочери (их выделяют в мтДНК). В Y-хромосоме выделяются два вида маркеров. Они определяют «гаплогруппу» и «гаплотип» людей. Но гаплогруппа не является совокупностью гаплотипов. Это самостоятельный маркер. Особая группа генетических маркеров изучается молекулярной генетикой в рамках полногеномного анализа однонуклеотидного полиморфизм. В совокупности они характеризуют генетический портрет популяций. Результаты одного из первых широкомасштабных исследований по технологии молекулярной генетики приведено в публикации [Atzmon, 2010].

2. Новые данные по генетике евреев
Авторы публикации [Atzmon, 2010] привели результаты полногеномного анализа однонуклеотидного полиморфизма 7 еврейских популяций. Их выделение выполнено по географическому, этническому и этно-географическому принципам. По географическому принципу выделены итальянские, турецкие и греческие евреи. Напомним, что к евреям, автохтонным жителям этих регионов – «классическим античным евреям», в конце 15 века добавились сефарды, изгнанные из Испании. По этническому – евреи ашкенази. По этно-географическому – евреи мизрахи отдельно для Сирии, Ирака и Ирана. Всего во внимание принято 237 результатов тестирования. При их интерпретации использованы базы данных «Human Genome Diversity Project» и «The Population Reference Sample». В них включены «146 non-Jewish Middle Easterners (Druze, Bedouin and Palestinian), 30 northern Africans (Mozabite from Algeria), 1547 Europeans, and 653 individuals from other African, Asian, Latin American, and Oceanian populations.». Выполнены расчеты генетических расстояний между популяциями, которые обработаны методами главных компонент (principal component analyses) и многомерного шкалирования (multi-dimensional scaling).
По результатам анализа генетических данных авторы публикации [Atzmon, 2010] сделали вполне определенные выводы. Они приведены ниже с нашими комментариями.
1. Рассмотренные популяции евреев связаны между собой генетически, что говорит об их общем происхождении. Этот вывод представляется вполне обоснованным и соответствует аналогичному выводу, сделанному на основе анализа гаплогрупп Y-хромосомы евреев.
2. «STRUCTURE results show that the Jewish Diaspora groups all demonstrated Middle Eastern ancestry, …». Здесь имеются некоторая географическая неопределенность. Что авторы публикации понимают под термином «Средний восток»? Выше мы привели цитату: «146 non-Jewish Middle Easterners (Druze, Bedouin and Palestinian)». Друзы и палестинцы – это жители самой западной части региона, обычно называемого «Ближний Восток». Скорее всего, бедуины представлены тоже жителями этого региона. К Среднему Востоку отнесены и мизрахи Сирии, хотя общепринято относить эту страну к Ближнему Востоку. Отнесение мизрахов Ирака и Ирана к Среднему Востоку соответствует общепринятому выделению этого региона. Отметим, что термин «Ближний Восток» в публикации не фигурирует.
3. «There is almost no European ancestry in Iranian and Iraqi Jews, whereas Syrian, Sephardic, and Ashkenazi Jews have European admixture ranging from 30%~60%.». Этот вывод соответствует приведенным в публикации фактическим данным. Европейская составляющая генома наибольшая у ашкенази (Figure 2). Высока она у итальянских, греческих и турецких евреев, плавно уменьшается в восточном направлении – сирийские, иракские и иранские евреи.
4. Ашкенази отличаются высокой генетической однородностью, что не соответствует времени появления их предков в Европе – 10 век. Несоответствие объяснено на основе такой категории популяционной генетики, как «бутылочное горлышко». Это резкое сокращение численности популяции с потерей генетического разнообразия. «Бутылочных горлышек» могло быть несколько. Действие этого фактора было в период до 15 века. Затем численность ашкенази возросла с 50 тысяч в его начале до 5 миллионов в начале 19 века.
В рассмотренных генетических данных авторы публикации [Atzmon, 2010] не выявили признаки «классических античных евреев». По результатам выполненного нами анализа в генетических портретах популяций евреев действительно не просматриваются составляющие, которые могли быть отнесены к этой общности, фигурирующей в Традиционной Истории. Кроме того, авторы публикации при описании результатов исследований «потеряли» евреев, которые жили в Анатолии, Италии на Балканах, до появления там сефардов. То есть к последним отнесены все евреи Турции, Греции и Италии (см. пункт 3 результатов). Действительно, евреи Турции и Греции генетически однородны. Такое могло быть только в двух случаях: до появления сефардов на территории Турции и Греции евреи не проживали; сефарды не переселялись на территорию этих стран.
Отдельного рассмотрения заслуживают три вопроса: локализация прародины евреев, направления их миграции в последние столетия и причины высокой генетической однородности ашкенази.

далее тут: http://artifact.org.ru/hronologiya-s-raznih-tochek/a-m-tyurin-molekulyarnaya-genetika-evreev.html